La región de la Mojana se encuentra localizada en el norte de la República de Colombia. Esta region forma parte de la 'Depresión Momposina', una gran cubeta o zona baja inundable creada por el plegamiento de rocas sedimentarias, levantado hacia finales del Terciario hace unos 20 a 30 millones de años por la subducción lenta de la placa tectónica del Caribe bajo la placa de Sudamérica. Desde su formación, la Mojana ha sido irrigada por los desbordes naturales del río Cauca en su margen izquierda, conformando todo un sistema hídrico de drenaje que involucra múltiples caños y ciénagas, que posibilitan la distribución de agua y sedimentos, función básica que garantiza el aporte continuo de nutrientes y la riqueza ecosistémica de la región. Actualmente, la Mojana presenta múltiples problemáticas de carácter social, económico, institucional y ambiental, generadas como consecuencia de una serie de actuaciones antrópicas inadecuadas, dos de las cuales son quizás las más determinantes: La construcción de la carretera San Marcos – Majagual – Achí, que obstruyó el libre flujo de las aguas de desborde del río Cauca, originando impactos ambientales importantes relacionados con el régimen hídrico y con el aumento de las áreas de inundación y, la construcción del Dique Marginal del río Cauca entre Nechí – Achí, que constriñó la capacidad del río Cauca para conducir adecuadamente los caudales de avenida y los correspondientes desbordes controlados hacia los caños. Estas dos megaestructuras generaron cambios importantes en el régimen hídrosedimentológico del ecosistema y de la región, configurando igualmente un nuevo régimen hídrico así como un nuevo mapa de inundaciones. Este artículo, aplica como estudio de caso la metodología de Evaluación Sistémica del Impacto Ambiental – ESIA [Vega et al, 2013] para cuatro diferentes alternativas de manejo hidrosedimentológico en la región de La Mojana, lo que permite definir de manera cualitativa, el grado de deterioro y/o mejoramiento ambiental sobre cada factor ambiental considerado y el grado de agresividad y/o bondad de cada alternativa sobre el medio ambiente. Finalmente se plantean algunas conclusiones derivadas de este proceso, donde se resalta la alternativa 4 (condición ambientalmente sostenible), por ser la que más mejoramientos y bondades ambientales generaría.